Profesor Ordinario de Carrera, “Titular” Nivel: “B”
Sistema Nacional de Investigarores: Nivel II

Ubicación: Lab 115 CONJUNTO “E”
Correo Institucional: sotres@unam.mx
Correo alterno: sostres@quimica.unam.mx
Tel: (+52 55) 56225285
Presentación del Grupo de Investigación (RRS)

Formación Académica

Licenciatura: Ingeniero Bioquímica ITESM
Maestría: Ciencias Químicas UNAM.
Doctorado: Ciencias Químicas UNAM.
Postdoctorado: Fisiología de Semillas, King’s College London, University of London.
Sistema Nacional de Investigarores: Nivel II.
Premios y Distinciones: Medalla Gabino Barreda por Maestría y por Doctorado

Desarrollo Profesional

Líneas de Investigación

El Pirofosfato (P2O7) es un metabolito que se genera como subproducto de las reacciones de biosíntesis de ácidos nucleicos, proteínas y carbohidratos complejos en todos los seres vivos. Para que este compuesto no se acumule e impida el crecimiento celular existen las enzimas conocidas como pirofosfatasas inorgánicas solubles. Dichas enzimas son pues esenciales en todas las células vivas y su función es reciclar el pirofosfato para que la célula pueda reutilizar el fosfato. Al hidrolizar el pirofosfato liberan energía y esta energía proporciona de un impulso termodinámico al crecimiento celular.

Metabolismo Vegetal, Relación Fósforo-Carbono en el Metabolismo Vegetal, Enzimología, Relación estructura-función de Proteínas.

Modelo esquemático de la estructura tridimensional de la Pirofosfatasa 6 del frijol común obtenido in sílico. El modelo fue sometido a una simulación de dinámica molecular en la Supercomputadora de la UNAM (Kambalam) y fué simulado en solución acuosa, en presencia de su activador esencial (Mg, esferas verde) y con su sustrato depositado en el posible sitio activo (P2O7, esferas rojas y cafés). Los restos de aminoácido que hacen contacto con el sustrato o con magnesio se muestran en forma de varillas.

En nuestro laboratorio se estudia el metabolismo de semillas durante el desarrollo, particularmente efocado al papel del pirofosfato y las pirofosfatasas sobre la acumuilación de lípidos de reserva, así como la relación estructura-función de proteínas, con énfasis en el estudio de las pirofosfatasas solubles y la regulación por hormanas y estímulos abióticos del metabolismo de semillas, con énfasis en el papel del potencial osmótico, el calcio, ácido abscísico, y los brassinosteroides.

Metodologías

Cinética Enzimática, Análisis Bioquímico, Producción de proteínas recombinantes, Modificación genética de plantas, Transcriptómica, Proteómica, Modelado y Simulaciones de Dinámica Molecular de Macromoléculas Biológicas.


Publicaciones:
63 indexed + 4 non indexed

  • Díaz-Rojas M, González-Andrade M, Aguayo-Ortiz R, Rodríguez-Sotres R, Pérez-Vásquez A, Madariaga-Mazón A, Mata R. Discovery of inhibitors of protein tyrosine phosphatase 1B contained in a natural products library from Mexican medicinal plants and fungi using a combination of enzymatic and in silico methods*. Front Pharmacol. 2023 Oct 31;14:1281045. doi: 10.3389/fphar.2023.1281045. PMID: 38027024; PMCID: PMC10644722.
  • Castro-Rodríguez, José Augusto, et al. “Determinants for an Efficient Enzymatic Catalysis in Poly(Ethylene Terephthalate) Degradation.” Catalysts, vol. 13, no. 3, 2023, p. 591. ProQuest One Academic; Publicly Available Content Database; SciTech Premium Collection, https://doi.org/https://doi.org/10.3390/catal13030591.
  • Vergara R, Berrocal T, Juárez Mejía EI, Romero-Romero S, Velázquez-López I, Pulido NO, López Sanchez HA, Silva DA, Costas M, Rodríguez-Romero A, Rodríguez-Sotres R, Sosa-Peinado A, Fernández-Velasco DA. Thermodynamic and kinetic analysis of the LAO binding protein and its isolated domains reveal non-additivity in stability, folding and function. FEBS J. 2023 Sep;290(18):4496-4512. doi: 10.1111/febs.16819. Epub 2023 May 29. PMID: 37178351.
  • Trejo-Fregoso R, Rodríguez I, Ávila A, Juárez-Díaz JA, Rodríguez-Sotres R, Martínez-Barajas E, Coello P. Phosphorylation of S11 in PHR1 negatively controls its transcriptional activity. Physiol Plant. 2022 Nov;174(6):e13831. doi: 10.1111/ppl.13831. PMID: 36444477; PMCID: PMC10107491.
  • Pérez-Vásquez A, Díaz-Rojas M, Castillejos-Ramírez EV, Pérez-Esquivel A, Montaño-Cruz Y, Rivero-Cruz I, Torres-Colín R, González-Andrade M, Rodríguez-Sotres R, Gutiérrez-González JA, Madariaga-Mazón A, Mata R. Protein tyrosine phosphatase 1B inhibitory activity of compounds from Justicia spicigera (Acanthaceae). Phytochemistry. 2022 Nov;203:113410. doi: 10.1016/j.phytochem.2022.113410. Epub 2022 Aug 27. PMID: 36030904.
  • Torres-Rodríguez MD, González-Segura L, Rodríguez-Sotres R, Juárez-DíaZ JA, Cruz-Zamora Y, Cruz-García F. High resolution crystal structure of NaTrxh from Nicotiana alata and its interaction with the S-RNase. J Struct Biol. 2020 Oct 1;212(1):107578. doi: 10.1016/j.jsb.2020.107578. Epub 2020 Jul 16. PMID: 32682729.
  • Zúñiga-Sánchez E, Rodríguez-Sotres R, Coello P, Martínez-Barajas E. Effect of catalytic subunit phosphorylation on the properties of SnRK1 from Phaseolus vulgaris embryos. Physiol Plant. 2019 Mar;165(3):632-643. doi: 10.1111/ppl.12761. Epub 2018 Jul 30. PMID: 29766514.
  • Carrillo-Campos J, Riveros-Rosas H, Rodríguez-Sotres R, Muñoz-Clares RA. Bona fide choline monoxygenases evolved in Amaranthaceae plants from oxygenases of unknown function: Evidence from phylogenetics, homology modeling and docking studies. PLoS One. 2018 Sep 26;13(9):e0204711. doi: 10.1371/journal.pone.0204711. PMID: 30256846; PMCID: PMC6157903.
  • Páez-Franco JC, González-Sánchez I, Gutiérrez-Nájera NA, Valencia-Turcotte LG, Lira-Rocha A, Cerbón MA, Rodríguez-Sotres R. Proteomic Profiling Reveals the Induction of UPR in Addition to DNA Damage Response in HeLa Cells Treated With the Thiazolo[5,4-b]Quinoline Derivative D3ClP. J Cell Biochem. 2017 May;118(5):1164-1173. doi: 10.1002/jcb.25753. Epub 2016 Dec 29. PMID: 27684057. Ver mas aquí

Colaboraciones:

Colabora con el grupo de Fisicoquímica, Evolución y Función de Proteínas en la Facultad de Química dirigido por la Dra. Rosario Muñoz y con los grupos del Dr. Martín González, el Dr. Alejandro Sosa y el Dr. Alejandro Fernández en la Facultad de Medicina. En la Facultad de Química colabora con el área de Cultivo de Tejidos Vegetales de la Facultad de Química, con el grupo de Química Farmacéutica del Dr. Alfonso Lira, con el grupo de Productos Naturales a cargo de la Dra. Rachel Mata y con el grupo de Biocatalisis de la Dra. Amelia Farrés. Ha tenido también colaboraciones con otros grupos de la Facultad de Química.

Proyectos y Patentes:

Financiamiento: CONAHCyT, Supercómputo LANCAD-DGTIC-UNAM
Patentes: 1

Membresía en sociedades científica:
Sociedad Mexicana de Bioquímica

Docencia:
No. de alumnos graduados en Licenciatura: 19
No. de alumnos graduados en Posgrado: 6
No. de alumnos que ha guiado en Post-Doctorado: 5
Grupo de Investigación: Departamento de Bioquímica, Laboratorio 115.

Comparte esta página