Profesor de Carrera Asociado “C”de T.C.
Sistema Nacional de Investigadores: Candidato
Ubicación: Laboratorio 103, Conjunto E, Departamento de Bioquímica, Facultad de Química.
Teléfono: (55)56225278
Correo institucional: vmiguelpalomar@quimica.unam.mx
Correo alterno: vmiguelpalomar@gmail.com
Referencia sitio web: Palomar lab
Presentación Coloquio Invernal XVIII 2025
Formación Académica
Licenciatura: Biología, Facultad de Ciencias, UNAM.
Doctorado: Doctorado en Ciencias Biomédicas, Instituto de Biotecnología, UNAM
Post-Doctorado: Universidad de Michigan, Ann Arbor, Estados Unidos.
Desarrollo Profesional
Líneas de Investigación
- Análisis sobre la estructura tridimensional del nucleoide de cloroplasto en Chlamydomonas reinhardtii.
- Estudio sobre la topología del DNA de cloroplasto en términos de super-enrollamiento.
- Estudio evolutivo sobre la conservación de la estructura del nucleoide en organismos fotosintéticos.
- Análisis de la heterogeneidad topológica del genoma de cloroplasto.
Metodologías:
- Biología molecular de plantas.
- Biología molecular de organelos vegetales.
- Secuenciación de ADN de última generación.
- Bioinformática.
Premios y Distinciones:
Mención honorífica en examen de Doctorado (2021)
Publicaciones:
- Membrane association of active genes organizes the chloroplast nucleoid structure | PNAS
URL: https://doi.org/10.1073/pnas.2309244121 - PAP1 and PAP7 are required for association of plastid-encoded RNA polymerase with DNA | Plant Molecular Biology (springer.com)
- URL: https://doi.org/10.1007/s11103-024-01498-x
- Garcias-Morales, D., Palomar, M., Charlot, F., Nogué, F., Covarrubias, A. A., & Reyes, J. L.* (2023). N6‐Methyladenosine modification of mRNA contributes to the transition from 2D to 3D growth in the Moss Physcomitrium patens. The Plant Journal, 114(1), 7-22. DOI: 10.1111/tpj.16149
- Palomar, M., Fujii, S., Rothi, M. H., Jaksich, S., Coke, A. N., Wang, J., & Wierzbicki, A.* (2023). Transcription-directed membrane association organizes the chloroplast nucleoid structure. bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory).DOI: 10.1101/2023.05.12.540520
- Palomar, M., Jaksich, S., Fujii, S., Kuciński, J., & Wierzbicki, A.* (2022). High‐resolution map of plastid‐encoded RNA polymerase binding patterns demonstrates a major role of transcription in chloroplast gene expression. The Plant Journal, 111(4), 1139-1151. DOI: 10.1111/tpj.15882
- Palomar, M., Jaksich, S., Fujii, S., Kuciński, J., & Wierzbicki, A.* (2022). High-resolution map of plastid encoded polymerase binding patterns demonstrates a major role of transcription in chloroplast gene expression. bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory).DOI: 10.1101/2022.01.18.476797
- Palomar, M., Garcíarrubio, A., Garay‐Arroyo, A., Martínez-Martínez, C., Rosas-Bringas, O., Reyes, J. L., & Covarrubias, A. A.* (2020). The canonical RDDM pathway mediates the control of seed germination timing under salinity. The Plant Journal, 105(3), 691-707.DOI: 10.1111/tpj.15064
- Sosa-Valencia, G., Romero-Pérez, P. S., Palomar, M., Covarrubias, A. A., & Reyes, J. L.* (2017). Insights into the function of the phasiRNA-triggering MIR1514 in response to stress in legumes. Plant Signaling & Behavior, 12(3), e1284724.
DOI: 10.1080/15592324.2017.1284724 - Sosa-Valencia, G., Palomar, M., Covarrubias, A. A., & Reyes, J. L. (2016). The legume MIR1514A modulates a NAC transcription factor transcript to trigger phasiRNA formation in response to drought. Journal of Experimental Botany, erw380. DOI: 10.1093/jxb/erw380
- Castro-Camus, E., Palomar, M., & Covarrubias, A. A. (2013). Leaf water dynamics of arabidopsis thaliana monitored in-vivo using terahertz time-domain spectroscopy. Scientific Reports, 3(1). DOI: 10.1038/srep02910
- Contreras-Cubas, C., Palomar, M., Arteága-Vázquez, M., Reyes, J. L., & Covarrubias, A. A.* (2012). Non-coding RNAs in the plant response to abiotic stress. Planta, 236(4), 943-958. DOI: 10.1007/s00425-012-1693-z
- Camus, E. C., Palomar, M., & Covarrubias, A. A. (2012). Hydration dynamics of Arabidopsis thaliana under water deficit conditions monitored in-vivo by THz spectroscopy. In Imaging and Applied Optics Technical Papers, OSA Technical Digest (online) (Optica Publishing Group, 2012), paper SW4C.5. DOI: 10.1364/sensors.2012.sw4c.5
Proyectos:
- DGAPA-PAPIIT IA203424. El super-enrollamiento del DNA en el cloroplasto y su relación con la expresión genética.
- Diversidad, dinámica y efectos sobre la expresión genética de la organización de la cromatina del cloroplasto en Chlamydomonas reinhardtii.
Colaboraciones:
- Dr. Andrzej T. Wierzbicki, University of Michigan, USA
- Dr. Yoshiki Nishimura, Waseda University, Japan
- Dr. Sho Fujii, Hirosaki University, Japan
- Dra. Silvia Ramundo, Gregor Mendel Institute, Austria
- Dr. Erdogan Hakki, Selcuk University, Turkiye
- Dra. Alejandra Covarrubias, IBt, UNAM, Mexico
- Dr. Jose L. Reyes, IBt, UNAM, Mexico.
Grupo de Investigación: